Các tiêu chí phân loại cảng thủy nội địa dựa trên: Vị trí, vai trò và tầm quan trọng của cảng thủy nội địa đối với phát triển kinh tế - xã hội của vùng, địa phương hoặc một khu vực của địa phương; quy mô của cảng thủy nội địa bao gồm: cơ sở hạ tầng cảng, khả năng tiếp nhận phương tiện lớn nhất và số lượng hàng hóa, hành khách thông qua cảng trong 01 (một) năm.

Cảng loại I là cảng có tiếp nhận phương tiện thủy nước ngoài, có vị trí, vai trò và tầm quan trọng đối với phát triển kinh tế - xã hội của vùng: Đối với cảng hàng hóa khả năng tiếp nhận được tàu từ 3.000 tấn trở lên; số lượng hàng hóa, hành khách thông qua trong 01 năm từ Từ 1.500.000 tấn hàng/năm; có hệ thống kho bãi, nhà xưởng, thiết bị xếp dỡ cơ giới có khả năng bốc xếp container. Đối với cảng hành khách có khả năng tiếp nhận được tàu từ 300 khách trở lên, phục vụ hơn 200.000 khách/năm.

 Cảng loại II có vị trí, vai trò và tầm quan trọng đến việc phát triển kinh tế - xã hội của địa phương, đối với cảng hàng hóa khả năng tiếp nhận được tàu từ 1.000 tấn đến dưới 3.000 tấn; số lượng hàng hóa, hành khách thông qua trong 01 năm từ 1.000.000 tấn đến dưới 1.500.000 tấn/năm; cảng hàng hóa có hệ thống kho bãi nhà xưởng, thiết bị xếp dỡ cơ giới có khả năng bốc xếp container; đối với cảng hành khách có khả năng tiếp nhận được tàu từ 100 khách đến dưới 300 khách, phục vụ từ 100.000 khách đến dưới 200.000 khách/năm.

Cảng loại III có vị trí, vai trò và tầm quan trọng phát triển kinh tế - xã hội trong phạm vi một khu vực của địa phương; đối với cảng hàng hóa khả năng tiếp nhận được tàu dưới 1.000 tấn và có hệ thống kho bãi, thiết bị xếp dỡ (cảng hàng hóa); cảng hành khách có khả năng tiếp nhận được tàu dưới 100 khách, phục vụ dưới 100.000 khách/năm.

Thông tư quy định Bộ Giao thông vận tải có thẩm quyền công bố danh mục cảng thủy nội địa trên tuyến đường thủy nội địa quốc gia, đường thủy nội địa chuyên dùng nối với đường thủy nội địa quốc gia, đường thủy nội địa chuyên dùng đi qua hai tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương trở lên. Ủy ban nhân dân các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương công bố danh mục cảng thủy nội địa trên tuyến đường thủy nội địa địa phương, đường thủy nội địa chuyên dùng nối với đường thủy nội địa địa phương./.