Theo đó, Thông tư quy định căn cứ lập kế hoạch đầu tư cấp xã: Các kế hoạch phát triển kinh tế - xã hội của địa phương, các quy hoạch có liên quan và đề án xây dựng nông thôn mới cấp xã được cấp có thẩm quyền phê duyệt; Mục tiêu, đối tượng và tiêu chí của các chương trình mục tiêu quốc gia. Ưu tiên các dự án gắn với phát triển sản xuất và nâng cao thu nhập của người dân; Tình hình thực hiện kế hoạch phát triển kinh tế - xã hội và thực hiện các chương trình mục tiêu quốc gia giai đoạn trước; Nhu cầu và dự báo khả năng cân đối vốn (ngân sách trung ương, ngân sách tỉnh, huyện, xã, dân góp và các nguồn vốn hợp pháp khác) thực hiện các chương trình mục tiêu quốc gia.

Nguyên tắc lập kế hoạch đầu tư: Có sự tham gia của các tổ chức và cộng đồng dân cư trên địa bàn thôn, xã; Thực hiện dân chủ, công khai và minh bạch;  Đảm bảo khả năng cân đối nguồn lực của các cấp, khả năng đóng góp nguồn lực của cộng đồng.

Thông tư quy định, kế hoạch đầu tư cấp xã phải đảm bảo 04 nội dung: Tình hình thực hiện kế hoạch đầu tư cấp xã giai đoạn trước; Mục tiêu, định hướng đầu tư trong kế hoạch trung hạn/hàng năm; Giải pháp và kiến nghị; Danh mục dự án đầu tư.

Quy trình lập kế hoạch đầu tư cấp xã được thực hiện qua 07 bước sau:

- Bước 1: Thành lập đơn vị lập kế hoạch;

- Bước 2: Chuẩn bị lập kế hoạch;

- Bước 3: Họp kế hoạch cấp thôn;

- Bước 4: Dự thảo kế hoạch đầu tư cấp xã;

- Bước 5: Họp kế hoạch cấp xã;

- Bước 6: Tổ chức lấy ý kiến đóng góp của cộng đồng;

- Bước 7: Lấy ý kiến cấp trên và tổng hợp kế hoạch đầu tư cấp xã.

Thời gian thực hiện kế hoạch đầu tư cấp xã thực hiện theo quy định của Luật Đầu tư công và hướng dẫn của cơ quan cấp trên. Kinh phí tổ chức, thực hiện lập kế hoạch đầu tư cấp xã sử dụng từ nguồn kinh phí sự nghiệp được phân cấp và kinh phí sự nghiệp của các chương trình mục tiêu quốc gia được giao cho địa phương quản lý theo quy định của Luật Ngân sách nhà nước.

Thông tư quy định Ủy ban nhân dân các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương rà soát, điều chỉnh các quy định có liên quan về lập kế hoạch đầu tư cấp xã của địa phương (nếu có) phù hợp với quy định tại Thông tư này.

Đồng thời, chỉ đạo Sở Kế hoạch và Đầu tư chủ trì, phối hợp với các cơ quan liên quan giám sát, đánh giá và hướng dẫn chi tiết cho cơ quan cấp huyện, cấp xã tổ chức, thực hiện lập kế hoạch đầu tư cấp xã theo quy định; Chỉ đạo Sở Tài chính xây dựng định mức kinh phí hỗ trợ việc tổ chức, thực hiện lập kế hoạch đầu tư cấp xã phù hợp điều kiện của địa phương, báo cáo Ủy ban nhân dân cấp tỉnh để trình Hội đồng nhân dân cấp tỉnh ban hành.

Trước ngày 31/3 hàng năm, Ủy ban nhân dân cấp tỉnh báo cáo về tổ chức, thực hiện Thông tư này của năm trước đó, gửi Bộ Kế hoạch và Đầu tư để tổng hợp và giám sát.