Về cơ cấu tổ chức, biên chế: Sở Tư pháp có Giám đốc, không quá 3 Phó Giám đốc; có 6 phòng và 4 đơn vị sự nghiệp thuộc Sở gồm:
Phòng nghiệp vụ:
-    Văn phòng;
-    Thanh tra;
-    Phòng Xây dựng và thẩm định văn bản;
-    Phòng Kiểm tra và theo dõi thi hành văn bản quy phạm pháp luật;
-    Phòng Phổ biến, giáo dục pháp luật;
-    Phòng Hành chính tư pháp - Bổ trợ tư pháp.
Tổ chức sự nghiệp thuộc Sở:
-    Phòng Công chứng số 1;
-    Phòng Công chứng số 2;
-    Trung tâm Trợ giúp pháp lý nhà nước;
-    Trung tâm Dịch vụ bán đấu giá tài sản.
    Quyết định này thay thế Quyết định 2160/2005/QĐ-UBND ngày 30/6/2005 của UBND tỉnh Thừa Thiên Huế quy định về chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức bộ máy của Sở Tư pháp tỉnh Thừa Thiên Huế.