Theo đó, Thông tư số 55/2018/TT-BTC sửa đổi, bổ sung một số điều của Thông tư số 185/2016/TT-BTC quy định mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí thẩm định đủ điều kiện hoạt động dịch vụ quan trắc môi trường. Cụ thể, sửa đổi, bổ sung khoản 2 Điều 2 về tổ chức thu phí là Tổng cục Môi trường trực thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường; sửa đổi, bổ sung khoản 3 Điều 4 về thực hiện kê khai, nộp phí thu được theo tháng, quyết toán năm.

Điều 5 về việc quản lý và sử dụng phí của Thông tư số 185/2016/TT-BTC được sửa đổi quy định, tổ chức thu phí phải nộp 100% tiền phí thu được vào ngân sách nhà nước. Nguồn chi phí trang trải cho hoạt động thẩm định, thu phí do ngân sách nhà nước bố trí trong dự toán của tổ chức thu theo chế độ, định mức chi ngân sách nhà nước theo quy định của pháp luật.

Trường hợp tổ chức thu phí thuộc diện được khoán chi phí hoạt động từ nguồn thu phí theo quy định tại khoản 1 Điều 4 Nghị định số 120/2016/NĐ-CP được trích để lại 90% trên tổng số tiền phí thẩm định thực thu được để chi cho hoạt động thẩm định, thu phí và nộp 10% vào ngân sách nhà nước...

Thông tư số 55/2018/TT-BTC cũng sửa đổi khoản 2 Điều 2 Thông tư số 186/2016/TT-BTC quy định về mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí thẩm định hồ sơ cấp giấy chứng nhận an toàn sinh học biến đổi gen. Theo đó, tổ chức thu phí là Tổng cục Môi trường trực thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường thay cho Cục Bảo tồn đa dạng sinh học.

Tại điều khoản sửa đổi, bổ sung Điều 2 Thông tư số 190/2016/TT-BTC quy định mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí khai thác và sử dụng tài liệu địa chất, khoáng sản thì tổ chức, cá nhân khi đề nghị khai thác và sử dụng tài liệu địa chất, khoáng sản từ Trung tâm Thông tin, Lưu trữ và Tạp chí địa chất trực thuộc Tổng cục Địa chất và Khoáng sản Việt Nam, Bộ Tài nguyên và Môi trường phải nộp phí.

Trung tâm Thông tin, Lưu trữ và Tạp chí địa chất trực thuộc Tổng cục Địa chất và Khoáng sản Việt Nam, Bộ Tài nguyên và Môi trường được thực hiện thu phí theo quy định.

Ngoài ra, Thông tư số 55/2018/TT-BTC cũng sửa đổi, bổ sung thêm 4 thông tư khác. Cụ thể gồm: sửa đổi, bổ sung một số điều của Thông tư số 196/2016/TT-BTC quy định mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí khai thác, sử dụng thông tin dữ liệu đo đạc và bản đồ; sửa đổi, bổ sung Điều 2 Thông tư số 197/2016/TT-BTC quy định mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí khai thác, sử dụng thông tin, dữ liệu khí tượng thuỷ văn; sửa đổi, bổ sung khoản 2 Điều 2 Thông tư số 294/2016/TT-BTC quy định mức thu, chế độ thu, nộp, miễn, quản lý và sử dụng phí khai thác và sử dụng dữ liệu tài nguyên, môi trường biển và hải đảo và sửa đổi khoản 2 Điều 2 Thông tư số 62/2017/TT-BTC quy định mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí xác nhận đủ điều kiện về bảo vệ môi trường trong nhập khẩu phế liệu làm nguyên liệu sản xuất.

 Thông tư này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 10/8/2018.