Theo đó, Thông tư quy định đơn vị quản lý vận hành nhà ở có trách nhiệm thu và nộp số tiền thu được từ cho thuê, thuê mua và bán nhà ở thuộc sở hữu nhà nước hoặc hướng dẫn người thuê, thuê mua, mua nhà ở nộp trực tiếp vào tài khoản tạm giữ mở tại Kho bạc Nhà nước do cơ quan quản lý nhà ở làm chủ tài khoản trước ngày 30 hàng tháng.

Ngoài ra, Thông tư còn quy định việc thanh toán chênh lệch thuê nhà ở công vụ thực hiện trong trường hợp nếu tiền thuê nhà ở thương mại làm nhà ở công vụ cao hơn tiền thuê do người thuê phải trả thì người thuê phải trả tiền thuê nhà không vượt quá 10% tiền lương đang hưởng tại thời điểm thuê.