Theo đó, Thông tư sửa đổi các nội dung quy định tại Điều 6 về cửa khẩu và tuyến đường quá cảnh hàng hóa, cụ thể:

- Hàng hóa quá cảnh chỉ được phép qua các cửa khẩu quốc tế.

- Tuyến đường được vận chuyển hàng hóa quá cảnh thực hiện theo quy định của Bộ Giao thông vận tải.

Tại Khoản 4 Điều 11, Phụ lục 4, Phụ lục 5, Phụ lục 6A và Phụ lục 6b Thông tư số 22/2009/TT-BCT được thay thế cụm từ “Vụ Xuất nhập khẩu” thành “Cục Xuất nhập khẩu” để phù hợp với chức năng, nhiệm vụ được giao theo quy định.